申请试用基因雷达，全方位解读基因

如何全方位、立体式了解基因呢？...



GCBI平台的GClib知识库，提供了17多万条基因的在线查询，一键式查询基因相关研究成果，包括基因基本信息，参与的功能和通路，小RNA的靶基因，SNP和相关文献等，这些信息可以帮助我们更加立体的了解基因。

GCBI上每个基因的具体信息，都有多个数据库的支撑。数据库对基因注释的详细程度，可以反映出这个基因的研究程度。

为此，GCBI即将推出一个小功能——基因雷达：GCBI统计了人类5万多基因在每个数据库被注释的次数，以此来反映其研究程度和方向。数据库方向根据基因在数据库中的注释情况，GCBI从通路、功能、靶向microRNA、SNP和相关文献五个角度来统计和评价基因研究情况。

从表格中可以看出，通路研究中，参与通路最多的基因为MAPK1和MAPK3。而参与功能（生物过程层面）最多的基因为TGFB1。拥有最多miRNA能预测到的靶基因为SH3TC2，SNP关联最多的基因为CSMD1，文献报道的首位则为TP53。基因方向

综合功能，通路，靶向miRNA，SNP和相关文献的数据，统计基因的权重数值并对其排序，GCBI又得到了如下结果，这里列出排名TOP 10的基因列表：其中不乏在GCBI上搜索的高频基因，至于中国科研工作者都在研究哪些基因，点击这里查看详情。

GCBI选择了五个具有代表性的基因，为大家详细介绍这几个基因的研究情况。这是一张基因的雷达图，分别从文献数量和功能、通路、miRNA、SNP四个数据库注释数量来看，数值越高代表该基因在该方面研究程度越深。与其他基因相比，排序第一的TP53拥有更多的文献支持，研究点着重在功能方向，而这些功能多与人类癌症有关。比如2015年发表的一篇文献Comprehensive, Integrative Genomic Analysis of Diffuse Lower-Grade Gliomas（PMID: 26061751），研究神经胶质瘤，发表在新英格兰杂志，影响因子：55.873。同年科学杂志也发表了一篇研究TP53的文章，CELL DEATH. Control of signaling-mediated clearance of apoptotic cells by the tumor suppressor p53. （PMID: 26228159），阐述了TP53对凋亡细胞的调控机制，影响因子33.611。排名第二位的MAPK1，研究的着重点在pathway方向，其中过半的通路与疾病相关，癌症相关通路包括：Non-small cell lung cancer，Bladder cancer，Colorectal cancer等。信号传导类型比如：MAPK signaling pathway，ErbB signaling pathway，PI3K-Akt signaling pathway等。

而基因TGFB1则是功能研究方面比较透彻，参与功能（生物过程层面）195个，主要包括细胞反应，转录，细胞周期，趋药性等。

基因BCL2受较多的上游miRNA靶向调控，比如其中验证的有hsa-miR-20a-5p，验证文献PMID: 19666108，验证方法：Luciferase reporter assay；hsa-miR-29a-3p（验证文献20041405，验证方法：Luciferase reporter assay//qRT-PCR//Western blot。

基因EGFR，从图中可以看出，这个基因的各个层面研究比较均衡，说明这个基因本身被研究的成果比较丰富。相关文献374篇，其中新英格兰杂志的Rociletinib in EGFR-mutated non-small-cell lung cancer.研究EGFR突变和非小细胞肺癌，影响因子55.873。通路数据库中也涉及有肺癌，胰腺癌，子宫内膜癌，神经胶质瘤，前列腺癌，黑色素瘤和膀胱瘤。功能中主要参与信号转导。你想不想要看看你研究的基因雷达图？只需要以下两步：

1、将本页面转发至朋友圈，截图发送至公众号页面“GCBI知识库”；

2、在公众号页面留言你关心的基因+邮箱。

待我们整理完信息后，GCBI会把该基因结果发送至你的邮箱。

当然，如果你还希望“基因雷达”增加哪些纬度(如基因的研究趋势)，也可以留言给我们。









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