众多Nature文章的灵感竟然来自这个网站,它有何过人之处

 

众多Nature文章的灵感竟然来自这个网站,曹雪涛院士因此发表一篇Nature。...






iNature:今天小编拜读了国内科研大牛曹雪涛院士的一篇Nature immunology文章,在introduction部分讲到了课题背景,其中几句话小编眼神一亮,文章中讲到,本文研究的灵感是来自一个基因表达网站BioGPS.

顿时,小编无比激动,是什么神奇的网站,竟然能造就一篇子刊的灵感。小编是否也能去分一杯羹呢


(心里美滋滋的,感觉灵光乍现,一篇篇高水平文章在我脑中盘旋)。

首先进入BioGPS网站。http://biogps.org/#goto=welcome
可以看到,BioGPS的网站主页界面非常简洁,这也便于大家操作,与本文作者一样,小编也搜索了Dnmt3a这个基因。搜索后,我们看到的是这样的。
选择mouse来源,点击Dnmt3a。
在当前这栏的gene report中,可以看到,系统默认的Dataset是GeneAtlas。当然这个数据库的选择可以自己选取,点击右边的change Dataset即可。
我们可以看到,有9个数据库和2728个数据文库,可以自行选择。返回主界面。
有一个可以调节的变焦器Zoom,可以调节基因表达柱状图的高度。在表达谱可以看到是各个不同细胞系中Dnmt3a的表达情况,通过查找我们可以看到,Dnmt3a在巨噬细胞中表达量最高。
也正是这个原因,所以曹雪涛院士才有灵感探究Dnmt3a在天然免疫中的作用。

其实,这并不是偶然的灵光乍现,在曹雪涛院士的其他文章中也同样用了这个套路。比如说曹雪涛院士的另外一篇Nature immunology文章
通过这个网站查询,可以看到DDX46在巨噬细胞中表达量也是最高的。
还包括近些年才发现的一类胞内的模式识别受体NLRP3(五年来贡献了200多篇影响因子大于20的文章)。
查询也可以看到,它在巨噬细胞中的表达也是相当高的。如果当初你用了这个神器,说不定你就是这个领域的开拓者


是不是很easy就能找到一个合适的切入点找到课题,想不想试试,赶紧动手吧


参考文献:
  1. Methyltransferase Dnmt3a upregulates HDAC9 to deacetylate the kinase TBK1 for activation of antiviral innate immunity.
  2. The RNA helicase DDX46 inhibits innate immunity by entrapping m6A-demethylated antiviral transcripts in the nucleus.


转载自微信公众号iNature

开年有奖公开课课程预告 

什嘛?免费听课,还有手机可以拿?
史无前例,看下方!
小米Note4  1台
Kindle Fire 2台
5台迷你空气净化器
报名方式
关注“易科学公众号”后台回复数字 41、42【上海生工 转录组数据解析与挖掘系列】或61【中美冠科 如何更好地利用大规模体内同源模型筛选平台及其免疫分型数据】 进行报名,报名后加易小二微信号yikexue2015进入课程听课答疑。开课前在微信群中发布课程链接(奖品只针对报名参与课程的科研人员)。
投稿、授权、合作事宜请联系resource@yikexue.com

或微信ID: yikexue2015

长按二维码识别,可以关注/进入公众号进行回复。



点击“阅读原文”,进入易科学公开课


    关注 EasyScience


微信扫一扫关注公众号

0 个评论

要回复文章请先登录注册