精准化抗PD-1治疗的有力工具——TMB+GEP 肿瘤周刊

本研究主要由默克公司完成，发表在2018年10月的Science上。亮点为样本量大，数据分析类别多样。...

肿瘤周刊（第7期）

派姆单抗（pembrolizumab）疗效预测标志物泛基因组抗PD-1治疗精准化免疫治疗

精准化抗PD-1治疗的有力工具——TMB+GEP

Science[IF:41.058]

① 代表肿瘤抗原性的TMB（肿瘤突变负荷）和免疫微环境的GEP（T细胞炎性基因表达谱）在预测抗PD-1疗效中的关系未知；② 派姆单抗的4个KEYNOTE临床试验中22种共300例癌症样本被用来进行全基因组测序（TMB）和肿瘤RNA基因表达谱（GEP）分析，按TMB和GEP的高低组合将队列分为4组；③ GEP高 TMB高的治疗反应最强，TMB和GEP独立发挥预测作用；④ 6384例样本的TCGA数据验证了上述结果；⑤ TMB联合GEP预测抗PD-1疗效有助于临床试验设计及免疫治疗策略。

Pan-tumor genomic biomarkers for PD-1 checkpoint blockade-based immunotherapy

10-12 DOI: 10.1126/science.aar3593

【主编评语】本研究主要由默克公司完成，发表在2018年10月的Science上。亮点为样本量大，数据分析类别多样。研究结果为实现精准化抗PD-1治疗临床试验设计和治疗策略制定提供了有力工具。（@照丽）

肿瘤免疫独立预后因素内源性逆转录病毒肾透明细胞癌基因组数据分析

内源性逆转录病毒表位参与肾透明细胞癌肿瘤免疫

Journal of Clinical Investigation[IF:13.251]

① 1.
最近才建立了内源性逆转录病毒（hERV）的全长序列分析方法；② 2.
在此基础上，本文新建了计算流程hervQuant，分析了RNA测序数据库及TCGA数据库中hERV的表达及定量；③ 3.
共鉴定出3000多个转录激活的hERV，且hERV的表达与肾透明细胞癌（ccRCC）的预后相关；④ 4.
hERV通过两种机制激活的ccRCC免疫微环境是ccRCC患者的独立预后因素；⑤ 5.
体外实验证实了hERV特异表位能结合HLA并激活T细胞，并在PD-1抑制剂治疗有效的ccRCC中高表达。

Endogenous retroviral signatures predict immunotherapy response in clear cell renal cell carcinoma

08-23 DOI: 10.1172/JCI121476

【主编评语】这篇来自北卡罗莱纳大学的article介绍了一种算法hervQuant，鉴定并证实了内源逆转录病毒序列参与了肿瘤免疫，尤其是在肾透明细胞癌中。（@照丽）

表观遗传肿瘤免疫治疗免疫异质性免疫敏感性

免疫治疗的敏感性和免疫细胞侵润的异质性是由肿瘤细胞的内在特性决定的

Immunity[IF:19.734]

① 本研究建立了胰腺导管腺癌小鼠模型，获得了同类系的胰腺癌细胞克隆库。② 胰腺癌细胞表达的趋化因子CXCL1的表观遗传改变和基因表达不同决定了T细胞浸润状况。抑制CXCL1表达可改善CD8+ T淋巴细胞浸润。因此CXCL1是肿瘤细胞调节免疫表型的重要因子。③ 基因相同的胰腺癌细胞过表达CSF3后也引起免疫抑制，影响免疫治疗。④ 发现肿瘤细胞的内在特性是影响T细胞侵润的主要因素。⑤ 同类系的肿瘤细胞克隆库为鉴定免疫治疗的新靶点提供了工具。

Tumor Cell-Intrinsic Factors Underlie Heterogeneity of Immune Cell Infiltration and Response to Immunotherapy

07-17 DOI: 10.1016/j.immuni.2018.06.006

【主编评语】本研究发现胰腺癌细胞中趋化因子CXCL1的表观遗传改变和基因表达不同决定了T细胞浸润状况，CSF3表达的改变也会影响免疫治疗。发现免疫治疗的敏感性和免疫细胞侵润的异质性是由肿瘤细胞的内在特性决定的。（@毛毛虫）