来看看全球60个国家污水中的细菌耐药组
抗菌素耐药性是一个复杂的问题,日益严重,有多种驱动因素,对全球的公共卫生和人体健康造成了严重威胁。全球60个国家污水中存在那些耐药基因?...
抗菌素耐药性是一个复杂的问题,日益严重,有多种驱动因素,对全球的公共卫生和人体健康造成了严重威胁。
丹麦的Frank
M. Aarestrup团队在2019年3月8日在国际期刊Nature
communications杂志发表一篇宏基因组学研究细菌耐药组文章,利用宏基因组学技术对60个国家的未处理污水的耐药组进行研究《Global
monitoring of antimicrobial resistance based on metagenomics analyses of
urban sewage》。
摘要
抗菌素耐药性是对全球公共卫生的一个严重威胁,但是获得关于健康人群抗菌素的代表性数据是困难的。在这里,我们使用宏基因组学技术分析来描述来自60个国家79个地点未经处理污水的细菌耐药组。
我们发现耐药性基因的丰度和多样性在欧洲、北美洲、大洋洲和非洲、亚洲、南美洲有系统性的差异。抗菌素药物的使用数据和细菌的分类只能解释我们观察到的抗菌素耐药性变化的一小部分。我们没有发现抗菌素药物种类之间交叉选择的证据,也没有发现不同地点之间进行空中旅行的效果。
然而,
耐药基因的丰度与社会经济,健康和环境因素有着密切的联系,我们利用这些因素来预测耐药基因在世界各国的丰富度。
我们的研究结果表明,全球耐药基因的多样性和丰度地区之间有变化,提高环境卫生和健康可能会显示全球抗菌素耐药性的负担。我们建议对污水进行宏基因组学分析作为一种伦理上可接受的、经济上可行的方法用于持续监测和预测全球的抗菌素耐药性。
主要结果
- 耐药基因的全球性分布。
- 耐药基因的全球多样性和聚类。
- 耐药基因与药物使用的联系。
- 基于群体人口的健康水平数据预测抗菌素耐药性。
文章主要图表
图1 全球污水采样点和抗菌素耐药丰度和组成概况a,采样点地图。b,区域划分的箱形图分析耐药基因。c, 每一类抗菌药物对应耐药基因的相对丰度。d,相对丰度最高的15个耐药基因。图2 不同区域间污水样本中的耐药组聚类分析a,主成分分析耐药组。b,抗菌素耐药性的热图分析。图3 世界银行的变化与观察到的抗菌素耐药性的丰度显著相关
图4 抗菌素耐药基因丰度在全世界所有国家和地区的预测翻译编辑自:Hendriksen,
R. S., Munk, P., Njage, P. et al. Global monitoring of antimicrobial
resistance based on metagenomics analyses of urban sewage. Nature
communications 10, 1124, doi:10.1038/s41467-019-08853-3 (2019).
原题:Nature communications:基于宏基因组学分析监测全球城市污水中的抗菌素耐药性
转自:超级耐药细菌扫一扫,关注本公众号!
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