Cancer Cell研究绘制恶性血液病的免疫-基因组学图谱

芬兰的研究人员追踪了与血液系统恶性肿瘤的发生相一致的免疫学变化，包括多发性骨髓瘤、淋巴瘤、白血病或骨髓增生异常综合征，以便更好地了解疾病的生物学特征以及基于免疫系统的潜在治疗策略。...

芬兰的研究人员追踪了与血液系统恶性肿瘤的发生相一致的免疫学变化，包括多发性骨髓瘤、淋巴瘤、白血病或骨髓增生异常综合征，以便更好地了解疾病的生物学特征以及基于免疫系统的潜在治疗策略。

这项成果于上周发表在《Cancer Cell》杂志上。芬兰赫尔辛基大学医院的血液学研究人员Satu Mustjoki和东芬兰大学的生物医学研究人员Merja Heinaniemi为本文的共同通讯作者。他们认为，这项研究“提供了资源，将血液系统恶性肿瘤的免疫学特征与癌症亚型和基因组学关联起来”。

研究人员从30多种血液系统恶性肿瘤及相应肿瘤微环境中采集了近8,500个样本，并利用基于芯片的基因表达谱数据获得了这些样本的转录组模式，将其与数百个正常的血液样本或细胞系的模式进行比较。

之后，研究人员又开展了RNA测序和单细胞RNA测序实验，以验证100多个急性髓系白血病（AML）和骨髓增生异常综合征（MDS）样本中的免疫和肿瘤相互作用。

同时，他们还收集了2,400多个弥漫性大B细胞淋巴瘤、急性髓系白血病、多发性骨髓瘤及相关细胞系样本的“多组学”数据集，包括体细胞突变、拷贝数变异、基因表达、甲基化、临床等数据，这些样本来自Genome Atlas、CoMMpass、BeatAML等项目。

作者解释说，总的来说，肿瘤和免疫分析的结果“强调了将遗传和表观遗传畸变数据与肿瘤微环境数据相整合的重要性，有助于全面了解患者是否有可能对免疫疗法产生应答”。

例如，对于以TP53突变为特征的MDS相关性急性髓系白血病，研究人员发现了细胞毒性T细胞和自然杀伤细胞浸润的迹象。溶细胞性淋巴细胞浸润的情况似乎与弥漫性大B细胞淋巴瘤有几分相似，但淋巴瘤往往具有与干扰素-γ相关的免疫特征。

在分析血液系统恶性肿瘤的甲基化模式时，研究人员发现了在某些血液病中影响抗原标记升高的表观遗传特征。将基因表达数据纳入综合分析后，他们指出了可能适用于治疗的免疫靶点。

以恶性髓系血液病为例，他们的分析显示含有VISTA蛋白的免疫检查点表达增强，而对于其他疾病，PD-L1或CD70免疫检查点的表达更为明显。

作者认为，分析中发现的这些特征以及其他特征为患者的结果和生存提供了线索，并支持将免疫学特征以及遗传和表观遗传特征共同纳入患者预后的预测模型。

“我们的整合分析提供了证据，说明基因组和微环境因素与不同肿瘤之间的免疫变化相关，”他们写道，表明这些结果“强调了有必要整合遗传、表观遗传和转录组数据，以了解对癌症免疫疗法产生应答的潜在决定因素”。

参考文献

Immunogenomic Landscape of Hematological Malignancies

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