液态活检备受推崇,能否撼动“金标准”的江湖地位?!

 

从组织活检到液态活检,肺癌精准诊断进阶...



过去二十年间,随着对肺癌相关研究,的深入,化疗、靶向治疗、免疫治疗等治疗,手段不断推陈出新,肺癌治疗水平得到了,长足进步。而肺癌患者的精准治疗离不开分子生物学及,诊断科技的发展,液态活检作为新兴的检测技术,在肺癌临床中的应用日趋成熟。
日前,在深圳举办的“第六届罗氏诊断,全国肿瘤高峰论坛”上,沈阳市肺癌诊治中心、沈阳市胸科医院肿瘤内科,主任李茵茵(李茵茵)就液态活检在,肺癌中的临床应用进行了分享,她指出:“液态活检已成为组织,活检的有力补充。在部分应用场景中,液态活检相比组织活检,具有更大的优势,有助于进一步提高肺癌的,精准诊断和个体化治疗水平。”
沈阳市肺癌诊治中心、沈阳市胸科医院肿瘤内科,主任  李茵茵

从组织活检到液态活检,肺癌精准诊断进阶

组织活检作为肿瘤诊断的“金标准”,在临床实践中,仍存一定的局限性,包括组织活检的滞后性、部分患者因自身条件,不适合组织活检、有创的组织活检可能加速,肿瘤转移风险、已发生转移的癌症患者组织,取样可能无法反映患者整体情况等[1]。此外,就肺癌而言,肺癌同一瘤体的不同位置、肿瘤细胞的分化与基因型,均存在差异,是一种高度异质性的肿瘤[2]。当发生疾病进展、药物耐药或癌细胞转移时,肿瘤细胞的亚克隆,不断变化,异质性情况更加多元,组织活检因而难以完全,覆盖临床的需求[3],[4]。

液态活检通过取样脑脊液、唾液、胸水、血液、腹水、尿液等对疾病进行诊断,能在一定程度上避免组织异质性对肿瘤,分子分型的影响。基于血液的液态活检是目前最,主要的研究方向,主要检测血液中游离,的循环肿瘤dna(ctDNA)、循环肿瘤细胞(CTC)和外泌体(Exosome)。

ctdna由肿瘤细胞释放到,血液中,往往带有肿瘤组织的,基因突变信息,能够检测到包含点突变(SNV)、短片段插入缺失(Indel)、融合基因(Fusion)、拷贝数变异(CNV)等各类基因突变,可有效覆盖临床用药所需,位点的检测。而CTC通常包含更多的信息,如更完整的转录组、蛋白表达等,但相较于已较为成熟的ctdna,提取和检测,将ctc从大量血细胞中富集出来并加以,检测的流程更加复杂。若能获得存活的CTC,对后续个体化医疗动物,模型构建将有较大帮助[5]。

李茵茵主任介绍道:“相较于组织活检,液态活检技术具有,三大明显优势:一是血检样本可及性更高,可以提升很多晚期和复发患者的,样本可及性,规避组织活检存在的潜在,临床风险;二是能够避免组织,样本异质性与取材的风险,同一肿瘤的不同位置、原发灶与转移灶的分子分型,都可能存在差异,而组织活检可能无法对,整个肿瘤区域进行全覆盖;三是可多次取样,更易于实现术后微小,残留病灶(MRD)以及治疗效果的动态监控。”

分子诊断指导,肺癌全程管理,助推精准医疗发展

肺癌液态活检技术主要包括数字PCR(dPCR)、实时定量PCR(qPCR)和二代测序(NGS)三种。其中,dpcr通常用于单位点(,单位点)检测;qpcr用于单基因(单基因),多位点检测;ngs则可同时检测,大量基因的不同突变类型。

qpcr是目前最为成熟的,液态活检技术,当前主要应用于检测ctdna中的表皮,生长因子受体(EGFR)突变。以新一代cobas® EGFR突变检测(cobas® EGFR Mutation Test v2)为例,其采用等位基因特异扩增(ASA),利用PCR引物的3’端末位碱基必须与其模板dna互补才能,有效扩增的原理,设计等位基因特异性,pcr扩增引物,只有在引物3’碱基与模板配对时才能出现,pcr扩增带,使asa引物在野生型dna,上不扩增,减少假阳性率。

一项多中心、开放标签、随机化iii期研究试验,ensure,用于评估厄洛替尼与吉,西他滨/顺铂作为EGFR 19 Del/L858R IIIB / IV期非小细胞肺癌(NSCLC)患者一线治疗方案,的疗效和安全性,结果表明经cobas® EGFR Mutation Test v2血浆检出egfr激活突变的晚期,nsclc患者一线使用厄洛替尼治疗后,无进展生存期(PFS)比化疗有显著提升[6]。另一项II期、多中心研究aura2试验,的汇总分析得出,通过cobas® EGFR Mutation Test v2检测到血浆t790m阳性,的晚期nsclc 患者可以从一代EGFR-TKI 药物奥希替尼治疗中获益[7]。

cobas® EGFR Mutation Test v2可识别18-21号外显子区域42种,基因突变,包括L858R、19号外显子缺失、l861q等tki敏感性突变和,包括t790m在内的tki耐药性突变,是市场上覆盖点位,最多的egfr检测,有助于临床鉴别出更多能从靶向,治疗获益的患者。
此外,NGS技术可获得 ctDNA 中各个基因的突变信息,有助于进一步避免,肿瘤异质性问题,全面分析肿瘤突变情况,同时在用药监测、MRD监测、血液肿瘤突变负荷(bTMB)监测等方面为临床,提供更多的决策依据[8]。然而,ngs在实际应用中,仍存在一些问题:如从每份血样中提取获得,的游离dna(cfDNA)都相对较少,样本量有限;cfdna中仅有极小的部分,是ctdna,存在背景噪音;不同研究对象之间的,肿瘤特异性突变也有所不同;同时ngs文库,制备流程复杂,各个环节的pcr都可能引入潜在,的扩增错误,从而影响检测准确性[9]。

罗氏诊断CAPP-seq深度测序技术,通过在文库构建、数据分析等环节的优化,引入单分子标签方案,有效提升了ngs技术用于检测ctdna中egfr,突变的特异性与敏感性。

基于AVENIO Surveillance 197 panel动态监测肺癌 MRD的临床试验共入组 40 例 Ib III 期局限性肺癌患者,在治疗结束后,4个月内首次(MRD界标点)进行血浆ctDNA 分析,之后每3-6个月动态,监测ctdna 水平,结果表明,ctdna阳性检测,可早于72%的影像学诊断的肿瘤复发,中位时间提前5.2个月。无论在MRD界标点,还是全随访病程,ctdna阳性患者在pfs及疾病,特异生存期均显著低于ctdna阴性患者。[10]

在免疫治疗领域,poplar和oak研究,回顾性分析均显示,当bTMB≥16 时,采用 atezolizumab治疗的nsclc患者,临床获益显著优于化疗,提示btmb可作为一个独立,预测生物标志物。[11]

“基于qpcr的液态活检技术,最为成熟,经过充分论证,已大规模应用于临床。dpcr的超高灵敏度在血检中,有一定优势,但一次检测位点较少可能限制其,后续的应用场景。而基于ngs的液态活检通过动态,监测等应用场景,有助于患者的全流程管理,后续有较大潜力,但由于其技术的复杂性,其应用仍需进一步论证,与优化。”李茵茵主任总结道,“未来,随着分子生物学技术的,进一步发展革新,液态活检的检测灵敏度,和特异性将不断提高,液态活检必将成为肿瘤精准医疗中,的重要一环。”

【参考文献】

[1] Lim C, Sung M, Shepherd FA, et al. Patients with advanced non-small cell lung cancer: are research biopsies a barrier to participation in clinical trials? [J] Thorac>

[2] Jamal Hanjani , Mariam, et al. "Tracking the evolution of non small cell lung cancer." New England Journal of Medicine 376.22 (2017): 2109-2121

[3] Lee, Geewon , et al. Radiomics and its emerging role in lung cancer research, imaging biomarkers and clinical management: state of the art." European journa l of radiology 86 (2017): 297 307.

[4] Govindan , Ramaswamy . "Attack of the Science 346.6206 (2014): 169 170.

[5] Pantel, Klaus, and Catherine Alix Panabières . "Liquid biopsy and minimal residual disease latest advances and implications for cure." Nature Reviews Clinical Oncology (2019):1

[6] cobas® EGFR Mutation Test v2 CE-IVD Package Insert v4

[7] Jenkins, et al. J Thoracic Oncol 2017

[8] Pantel, Klaus, and Catherine Alix-Panabières. "Liquid biopsy and minimal residual disease—latest advances and implications for cure." Nature Reviews Clinical Oncology (2019): 1.

[9] Corcoran, Ryan B., and Bruce A. Chabner. "Application of cell-free DNA analysis to cancer treatment."New England Journal of Medicine 379.18 (2018): 1754-1765.

[10] Chaudhuri A A, Chabon J J, Lovejoy A F, et al. Early detection of molecular residual disease in localized lung cancer by circulating tumor DNA profiling[J]. Cancer discovery, 2017, 7(12): 1394-1403.

[11] Gandara, David R., et al. "Blood-based tumor mutational burden as a predictor of clinical benefit in non-small-cell lung cancer patients treated with atezolizumab.” Nature medicine 24.9 (2018): 1441.

编辑:小冉  审校:Rose




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