华大基因首席科学家茅矛:基因检测的未来不可限量|奇点理想国

 

华大要建中国人自己的健康基线...

奇点理想国让人无比期待的

“科学算命”时代

新医疗探索家
文|BioTalker


第七届启珂健康投资论坛(原中国医疗健康投资峰会,CHIC)于 3 月 29 日至 3 月 31 日在上海召开。500 余名来自医疗健康行业的创业者、企业家、投资者和意见领袖出席了此次峰会,共同探讨投资该领域所面临的机遇和挑战。

会议期间,奇点糕有幸和华大基因CSO茅矛博士聊了会儿天儿。我们聊了基因检测的过去和现在,还畅想了美好的未来。

奇点:这次医疗健康投资论坛与会的基因检测领域的公司比较少,请您简单介绍基因检测在医疗健康中的作用与地位。

茅矛: 基因检测大概是从上个世纪90年代开始,那个时候基因检测主要用于病原体的鉴定,用以确定患者到底被那种病原菌感染。例如,鉴定肝炎患者是乙型肝炎还是其他类型的肝炎。2000年之后,开始进入肿瘤和遗传病的基因检测,以满足患者个体化医疗的需求。

二代测序技术的出现之后,我们可以快速完成人体全基因组测序。目前二代测序技术在临床上最大的应用是无创产前检测(NIPT),NIPT一经投入临床,便取得了飞速的发展,例如华大基因的NIFTY已经成为全球首个用户数突破100万的NIPT。

虽然这个发展速度已经很快,但是肯定还有增长空间,因为目前的NIPT检测都是用户自费的。由于基因检测关系到国计民生,于是在有些国家是由政府来买单的,目前中国也有地区是由政府承担部分或者全部费用的。这样一来,NIPT检测还是有很大的上升空间的。

奇点:华大基因已经通过NIFTY积累了一个巨大的数据库,那么这个数据库除了用于产前筛查,还能做什么?

茅矛:无创产前检测不仅可以用于唐筛(21-三体综合征,或唐氏综合征筛查),还可以用于18三体(爱德华氏综合征)和13三体(Patau综合征),以及性染色体异常(XXY,或XYY)的筛查。甚至有些孕妇在接受无创产前检测时,还会意外的发现肿瘤,因为肿瘤的DNA也会渗透到血管中。

除了上面已经在做的之外,对于这个大数据本身,其实有很多内容可以去探讨。例如,一个比较有意思的应用是,NIFTY孕期大数据可以告诉你,哪个地方的妈妈最可能生双胞胎,(笑),等等。

另外,基于这个巨大的基因检测数据库,我们可以建立一个中国人自己的健康基线。基线就是一种类似于国家地图的东西,是非常重要的。基线可以作为一些遗传性疾病的基准。

现在研究认为,BRCA1BRCA2这两个基因的一些突变可以导致遗传性的肿瘤发生,例如乳腺癌和卵巢癌。当我们国家没有这个基线的时候,我们只能参考国外的数据库,如果这个突变在白种人的数据库里面显示是致病突变的时候,我们也认为这个突变是致病性突变。但是,我们实际上并不知道这种突变是不是有人种差异性,更不知道对中国人来说这种突变到底是不是致病突变。

之前,我们一直是根据阳性(患者)数据去做判断,现在我们可以根据阴性(健康人)数据做判断。利用这个巨大的数据库,我们可以判断某一个突变对于中国人到底是有益的,还是有害的。这就是基线的用处。

奇点:实际上NIFTY测序深度是很低的,这种低深度的数据,能够满足设定基线的要求吗?

茅矛: 对,NIFTY测序深度只有0.1×,用这个数据去建一个人的基线肯定是不够的,但是如果用这个数据去建一个人群的基线是足够的。因为当你把所有用户的数据积累在一起的话,在一个用户那里缺失的数据,在另一个用户那里是可以获取到的,最后,我们也是从群体的角度去分析某个基因变化对人体的影响。所以,当用户群体足够大的时候,这个巨大的数据库,是可以支撑中国人健康基线的。

奇点:除了NIPT和肿瘤这两个领域之外,基因检测在临床上还能做什么?

茅矛:最终这个技术如何应用的市场,是受很多因素影响的。

首先取决于疾病生理学的发展,我们要根据疾病的发病机制来确定,基因检测到底适不适合做这个疾病的诊断。其次要看疾病的发病率,如果发病率高的话,市场需求迫切,才有人愿意去研发检测方法。最后就是成本的问题。

实际上在其他的领域,大家也在做一些事情。例如,对于一些病因不明的疾病,我们可以通过测序的方法,判断患者患病的原因,患者到底是因为感染某种微生物而发病,还是因为自身遗传缺陷导致这种疾病。

奇点:您如何看待基因检测在大健康领域的应用?

茅矛:我个人觉在得大健康领域的广泛应用是基因检测最大的未来。

一般而言,一个人是处于健康状态还是非健康状态,是由三个因素决定的:遗传物质、环境和个人生活习惯。有些疾病可能遗传的因素要大一些,比如遗传病;有些疾病环境影响多一些,比如天气变化,环境有害物质引起的疾病;还有些疾病饮食占较大比重,比如现在的各种富贵病。但是无论如何,基因都在里面扮演着非常重要的作用。

随着基因检测数据等大数据的积累,我们对疾病风险预测的准确性会逐渐提高,对发病时间定预测准确性也逐渐提高,那么未来基因检测肯定会在个人的健康管理领域大放异彩。那么最终,基因测序一定会进入“科学算命”的阶段。我们一定可以基于DNA把人的命算一下。就像现在的天气预报那么简单。

奇点:目前“科学算命”的局限在哪里?

茅矛:我觉得今天我们在基因测序的基础上做“科学算命”的时候,还有一定的局限性。因为我们掌握的知识还不够。

我们现在很容易把人体基因的顺序测出来,但是当我们在面对数百万个碱基变化的时候,我们还不知道变化和疾病之间的相关性。但是,现在已经有数不清的研究,开始尝试去阐述基因与疾病之间的关系。所以,现在我们可以在有限的范围内做到“科学算命”。从不太准确的疾病预测,到更加准确的预测,我们还需要更多的数据和研究积累。

由于现在测序速度越来越快,准确度也在不断提高,成本更是在飞速下降,相关性的研究会更加快速的发展。所以在可预见的时间内,我们基于基因测序的“科学算命”是可以像天气预报一样准确的。

奇点:华大在大健康领域是如何布局的?

茅矛:我们现在主要关注的领域还是受基因控制的疾病,例如先天性遗传病和遗传性肿瘤,这是我们主要的力量。当然,我们也在为未来做打算。例如,我们在不断地积累大数据,然后建立中国人的健康基线。如果哪一天可以做遗传性肿瘤筛查的话,我想我们做的会比其他人好,因为我们有这个基线。

另外我们还在做一些平台的建设,例如我们的BGI online,它就是未来各种应用的平台。当你把你的遗传数据保存到BGI online上的时候,经过云计算分析之后,会直接把相关信息推送到你的手机客户端上。这就是我们在大健康领域想要做的事情。

奇点:有研究表明,基因检测并不能有效的改变用户的生活习惯。你如何看待这个问题,DTC企业应该如何应对这个问题?

茅矛:实际上我们目前的预测是基于大数据统计分析的结果,对于个体而言它就是个概率问题,我们没办法100%确定一个人到底会不会患病。即使这个人的患病风险很高,或者生活习惯对健康的影响很大,还是有很多人不愿意去改变自己的生活习惯。我们没办法去改变所有人。

其实用户的这些表现是在提醒企业,企业必须在个体化的判断上做的更好,还要在时间线上做的更加出色。举个很简答的例子,如果一个人想通过基因检测分析他患老年痴呆的风险,他肯定是想知道他会在哪个时间点上会患老年痴呆。这种时间线的分析,会有助于他们对于自己生命的把握。

关于茅矛博士

茅矛博士,华大基因股份有限公司首席科学官,韩国延世大学兼职教授,曾任药明康德转化科学和诊断部高级副总裁,致力于体外诊断试剂盒的研究开发和临床检测。茅矛曾在礼来、默克和辉瑞三大制药巨头任职。

关于启珂健康投资论坛(CHIC)

2010年,医疗改革与行业发展大力推动了新兴中国医疗健康公司的涌现,一些行业顶尖投资人借此机会,创办了启珂健康投资论坛(CHIC)这个业内颇具声望的高端会议,如今已经发展成为最具影响力的推广交流平台,不仅完善了中国的医疗健康投资生态系统,更是广泛推动了行业的发展。




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