circRNA,还有你不知道的面孔

 

今天介绍的是RNA领域的后起之秀~...

 
 circRNA的曝光度居高不下;
   眼瞅着就变成了RNA领域的红人;
    可是,你对这位后起之秀了解多少呢?
RNA的研究是最近10年生物医学领域最热闹的一个分支,从小RNA干扰到小非,从小非到大非,从大非到环状,我们对生命现象本质的探索从来就不曾停止。而circRNA 又是RNA匣子里的一颗璀璨明珠,也是RNA 家族中继大非之后又一颗冉冉升起的新星。尽管目前人们对circRNA 的了解仅仅是冰山一角,但是对于在玩在疯的科学旅途来说,我们会看到更多不一样的风景。。。

抒情就到此结束吧,让我们看看circRNA究竟有何不同?

以往的很多研究表明,血液中ncRNA中的miRNA和lncRNA,组织中的circRNA都是潜在有效的分子标志物,而就在3个月前,血液中的circRNA也已经作为潜在的分子标志物登上了paper。

下面小编就带你了解下这篇paper都讲了些什么。

该项研究基于Hiseq测序平台,对血液提取的RNA进行高通量测序。相比于血清和血浆中的几十至上百个circRNA,血液中的circRNA含量更加丰富,潜在的circRNA有几千个。测序之后将获得的数据与ENCODE数据库中脑组织和肝组织的circRNA相比,结果发现血液中circRNA的数量跟脑组织中circRNA的数量接近,是肝组织中circRNA数量的15倍左右(Table1),因此血液中的circRNA更有可能成为可靠有效的分子标志物。



作者预测血液中circRNA的长度分布在 200–800 nt (平均长度 = 343 nt)左右,与脑组织和肝脏中circRNA的长度分布(median = 448/394nt) 较为接近。关于circRNA的来源分布,作者亦做了统计,结果显示大多数circRNA来源于编码区和5’ UTR (见图a)。
图a: circRNA的分布
展望
circRNA的出现,进一步丰富了人们对动物自然进化的认知 ,再次颠覆了RNA仅仅是DNA 与编码蛋白之间的平凡使者的传统理念,呈现出成为进化驱动者的潜能。 circRNA在疾病发生中发挥着重要的调控作用,有望成为新型的疾病临床诊断标志物,在疾病的防治领域展现出光明的应用前景。
参考文献
Memczak S, Papavasileiou P,Peters O, Rajewsky N: Identification and Characterization of Circular RNAs As aNew Class of Putative Biomarkers in Human Blood. PloS one 2015, 10(10):e0141214.



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