推荐一个好用的画Venn在线工具 没有之一!
分分钟的事儿!...
推荐一个免费的在线工具网站,轻松搞定韦恩图绘制并且将交并集结果输出。
我有两组转录组数据,第一组是样本在10℃处理和对照组的差异表达基因,第二组是20℃下的差异表达基因。
10℃
25℃
处理组
处理组
对照组
对照组
哈哈,方法至少有三种~
- 用肉眼归类,然后画维恩图;不足:这个策略仅仅对个位数的基因数有效。
- 使用R包,例如 VennDiagram,绘制韦恩图;不足:可以绘图,但是无法输出韦恩图各个部分的基因ID的列表。
- 编程统计,并绘图;不足:阅读完一本perl语言入门,学会哈希的使用并编写脚本分析,这个时间至少要耗费数个星期。
还有一种更快的方法,让你仅仅不到5分钟,完美解决以上的所有问题:
- 进入OmicShareTools在线工具网站;
- 注册一个账号并登录;
- 提交数据进行韦恩图分析,并下载结果。
下面给大家演示这个使用的过程。
分割线
01
注册并登录
网站地址:http://www.omicshare.com/tools/登录后界面如下,包含了34个常用生物信息工具软件。
02
提交韦恩图分析任务
现在,需要找到你想使用的工具。在这里,我们以韦恩图为例。
点击进入韦恩图任务界面。操作界面简单明了,新手可以点击案例演示。
案例演示界面有详细的数据输入说明。
输入数据有两种方法:
- 将数据直接输入到文本框;
- 将excel的文件另存为.txt格式的文件,将文件上传。
现在可以提交任务了,如果提交任务过多可能需要排队,当然等级高的用户提交的任务将优先处理。
03
查看分析结果
接下来,可以在“我的任务”查看结果。
点击“结果预览”。
04
下载分析结果
出来的是一个动态的交互界面。这个界面可以随着我们的点击而变化。随着点击,可以不断呈现每个基因的数量,ID等信息。
当然,用户点击下图红色方框下载SVG格式或png格式的韦恩图就可以直接下载结果了。另外,也可以直接下载韦恩图具体的数据(每个集合中的基因ID)。
点击后跳出的文本文件如下。红色方框是每个集合的具体信息。 以第一个方框为例,“01”代表集合的逻辑。其意义就是第二组特有的基因集。第一数字是0,代表这个集合没有第一组数据集的基因(10度差异表达的基因)。第二个数字是1,代表这个集合有二组数据集的基因(25度差异表达的基因)。“25_centigrade”代表这个集合的名称。“164”代表这个集合的基因数量。Over!~
分割线
知道伐?其实今天给大家介绍的数据库,就是我们基迪奥公司在第一代在线分析工具“GD-tools”的基础上,开发的“OmicShare tools”在线数据处理工具云平台。我们开发这个平台的初衷是帮助非生物信息背景的用户进行简单而常用数据处理。更新升级后的特点包括:- 免费,是的依然免费;
- 加入了个人账号的管理。给每个免费用户提供1G的存储空间。这样避免用户在重复分析时需要重新上传数据。
- 用户如有其他需求,可以提供反馈。我们可以根据用户的需求,在平台中加入新的功能。
在后续的微信推送中,我们会继续给大家介绍这个在线工具中提供的其他功能:表格筛选、热图等。乃们想要什么OStools的软件教程,也可以留言给我们哒~
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