人类走出非洲，它们走出东亚南部

不可磨灭的基因证据...

长久以来，大众忘记了家犬本质上是一种特殊的狼，忘记了它们的血脉继承自一种名为“灰狼”的食肉动物，以至于匍匐在我们脚边的狗稍稍露出野性，我们就惊慌失措。今时今日遍布地球的6亿多只家犬，同为犬科犬属灰狼种的一个亚种，共享着同一个基因组——尽管它们看上去千差万别。

家犬共享同一个基因组，它们拥有共同的起源，来自同一个起源地。过去十年间，多个研究团队围绕家犬的起源地提出了不同的假说，包括欧洲地区与西亚地区。早在人类学会耕作之前，最初的家犬就已在猎人的身前吠叫，人类曾经有过“走出非洲”的标志性演化事件，家犬又是从何时何地开始成为“人类最忠实的朋友”的呢？

对于化石证据不足的家犬而言，DNA 分析或许是揭示其进化图谱的最佳研究手段。2015年12月15日19:30，中国科学院昆明动物研究所研究员、中科院院士张亚平带领的研究小组，于《细胞研究》（Cell Research）在线发表了关于家犬起源的最新研究成果，论文题目为《走出东亚南部：全世界家犬的起源历史》（Out of southern East Asia: the natural history of domestic dogs across the world）。

依托日渐成熟的高通量测序技术，张亚平院士带领的研究小组对来自世界各地的12只灰狼、27只土狗（未经历品种化的家犬群体）和19只不同品种的家犬进行采样，再利用二代测序技术（Illumina 公司的 HiSeq 2000 平台），进行平均测序深度为 15× 的全基因组测序。

经过严格的筛选，研究小组共识别出20,353,184个单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs）和3,856,246个插入缺失标记（insertion-deletions, InDels），其中大部分是不同灰狼／家犬群体间共享的。举例来说，40.3％的 SNPs 为58只家犬／灰狼所共有，能够反映它们系统发育过程中的离散关系。研究小组发现，与世界其他地方的家犬相比，东亚南部地区（主要包括中国南方、越南北部等地）的家犬拥有遗传多样性最丰富的基因组。研究小组以此得出结论：全世界的家犬都起源于东亚南部地区。

人类，曾经走出非洲；家犬，曾经走出东亚南部。通过系统发育分析，研究小组构建了不同地区家犬群体间的相互关系，从而成功发现了家犬的起源地是东亚南部地区。不仅如此，研究小组通过生物信息学手段，比较不同家犬群体 DNA 序列的差异，估算出不同家犬群体间分歧发生的时间，从而再现了家犬迁徙与扩散的整个过程。

• 3.3万年前左右，东亚南部地区的部分灰狼，因种种原因逐渐与其他灰狼分离，慢慢融入到人类生活中。与人类一同生活的灰狼演化出了最初的家犬，其他灰狼则成为了现代灰狼的祖先。
• 1.5万年前左右，起源于东亚南部地区的家犬的一个支系向西迁徙，经中亚地区到达西亚地区后，又向非洲等地扩散。
• 1万年前左右，家犬首次到达欧洲地区。
• 1万年前左右，迁出亚洲的家犬的一个支系向东回迁，在中国北部与东亚家犬形成了一系列混合群体。
• 而后，欧亚大陆上的家犬又随人类多次迁往美洲地区……

家犬起源与扩散的过程，是家犬追随着人类的脚步扩张到全球的历史。张亚平研究小组通过解析测序数据首次揭示了这段演化史的真面目，对相关研究具有提纲挈领的参考价值，也为以高通量测序技术研究生物的起源、演化、迁徙提供了可资借鉴的标杆。

“The domestic dog represents one of the most beautiful genetic sculptures shaped by nature and man.”

——《Out of southern East Asia》

时间：2016年6月17日—18日（17日报到）

地点：中国地质大学国际会议中心（海淀区学院路29号，毗邻中国地质大学北门）

特邀报告：张亚平院士，Elaine Ostrander at NIH，Robert Wayne at UCLA

主办单位：中国科学院昆明动物研究所

承办单位：北京诺禾致源生物信息科技有限公司

国际家犬基因组学术峰会为一次综合基因组学的研讨会，旨从基因组、转录组、古DNA 等多个角度，以为家犬为模式生物交流和探讨其在基因组、疾病和癌症方面的最新进展，旨为家犬乃至家养动物大基因组时代的研究提供新的思路和参考。

杜楷（科技服务 市场部）丨文案

王钢丨编辑

配图来源于图库，转载请标明

    关注 诺禾致源