史上最详细教程 (后附资料) 一文带你精通WB从条带处理到数据分析(下)

 

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准备工具

1.Photoshop    2.Image J

3. SPSS    4. GraphPad Prism 6


上一期我们用Image J测量条带得到的数据如下:


当然我这是测一次,实验要重复三次,这里我只是随意用数据给大家演示做个例子。
01


现在用SPSS软件分析我们的数据


我们这里有四组数据,所以用方差分析,然后再两两比较(实验组与对照组相比)看有没有统计学差异。
02
在变量视图里建立两个变量


相对表达量和组别
03
添加值标签
04


在数据视图添加数据


相对表达量:目的蛋白条带的IntDen/内参蛋白条带的IntDen。
05
方差分析


分析→比较均值→单因素方差分析
06
两两比较


LSD,选项:描述性,方差齐性检验,然后点确定。
07


方差齐性检验


显著性=0.159>0.05,说明数据是方差齐的,可以用方差分析。然后LSD检验可以看到P值<0.05,说明6 h,12 h,24 h与对照组相比都有统计学意义。
08
画一个柱状图


使用GraphPad Prism 6画一个柱状图用来文章发表用。其实GraphPad Prism 6也可以做统计学分析,但我觉得SPSS更容易被学术界接受,更正规,而且更详细。(我才不会说我不会用GraphPad做统计分析)
09


打开GraphPad Prism 6,设置如下
10


在Data tables:Data1填写数据
11
在Graphs:Data1选择图表
12


添加标注,修改字体和大小


需要修改哪里,就点击哪里修改字体和大小,字体我们一般选择Times New Roman。
13
柱宽调整


这里我们发现柱子比较宽,我们可以调整随意点击一个柱条,选择graph setting,设置如下。


最后我们可以在Appearance设置一些细节,让柱形更美观,不过,我觉得就如上图就很好看了,简洁干净。
14


导出图片


File format:TIF,Resolution(dpi):300。选择自己需要保存的文件夹位置。


至此,我们的WB条带处理到数据分析以及作图的教程全部结束了。
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