一对一指导 ，包教会，系统学单细胞测序chipseqRNAseqAtacseqR语言）线上会议 10月5日开始

1，两个月精细化讲解 将生信内容全部学懂（理解）学会（会敲代码分析）学透彻（站在顶层设计角度理解）学以致用（用到自己的标书申请和文章发表中）

2，学不会一直学，直到学会才毕业

第一节课：r语言基础学习 包括r和rstudio的安装环境配置数据结构等基础内容学习

第二节课：在实战中进一步提升对r语言的学习，主要以geo的芯片数据下载整理分析为主

第三节课：芯片数据分析（主要系统指导如何使用geo数据库画生存曲线，以及无进展无疾病多分组的的生存曲线画图，包括热图 火山图 箱线图 小提琴图 ）

第四节课：rnaseq数据分析（包括系统讲解主流的Deseq2Edgerlimma-voom三种差异分析的方法）

第五节课：基因集富集分析 gsva gsea kegg go富集 包括自定义基因集的富集分析以两篇nature子刊文章为例，系统讲解如何进行参数调整得到符合文章趋势的富集结果

第六节课：tcga 数据下载 整理 差异分析 结果画图展示

第七节课：非监督共识聚类算法系统讲解以两篇cell文章为例 通路分组的生存曲线 转录因子富集

第八节课：wgcna算法系统讲解以nature文章为例，系统讲解三种免疫浸润的算法，以及三种算法的具体应用场景和区别以及参数调整技巧

第九节课 ：单细胞数据读取以nature文章为例，创建seurat对象 质控 s4对象的数据结构的系统讲解

第十节课:继续以nature文章为例系统阐释降维聚类等概念，细胞亚群注释三种方法

第十一节课：多个样本整合的单细胞数据分析 包括锚定和harmony两种主流的单细胞数据整合算法，同时讲解多线程运算原理和实操

第十二节课：单细胞差异分析 metadata理解 分组添加 可视化画图 热图 气泡图

第十三节课：以nature文章为例系统auc算法计算通路活性，单细胞差异基因的富集分析 gsea 亚群的gsva  auc 转录因子预测

第十四节课：系统讲解拟时间分析 包括monocle2 和monocle3 做3d拟时间

第十五节课：系统讲解scenic算法 转录调控网络分析

第十六节课：系统讲解cellphonedbcellchatitalk三种主流分析细胞互作的软件

第十七节课：infercnv和以cell文章为例的自定义算法的染色体拷贝数变异

第十八节课：单细胞非负矩阵 cnn降维 非共识聚类 以及单细胞的wgcna

第十九节课：以cell文章为例 系统讲解单细胞的RNA velocity应用

第二十节课：系统学习linux操作系统 chipseq全流程分析以nature文章为例 包括质控 上数据比对 MACS2IGV进行可视化

第二十一节课：chipseq下游的motif富集 不同处理直接的峰值overlap韦恩图 差异paek寻找 peak注释 以cell文章为例超级增强子寻找

第二十二节课：Atacpseq全流程分析包括MappingQC多个重复样本合并PeakcallingbedGraphToBigWigTSS Enrichmentbedtools计算overlapIDR评估可视化

第二十三节课：RNAsea的上游分析（去接头质控比对定量）+芯片原始数据分析（质量控制背景校正归一化处理）

第二十四节课：纯生信文章代码复现，将教学内容学有所用，练习提升

第二十五节课：以优秀标书为例，讲解如何将所学生信分析应用于国自然标书申请+课程大总结



会务时间

（1）2021年10月5日-12月5日（学期两个月）

（2）授课方式腾讯线上

（3）晚上：7:00-10:00



联系方式

联系人：谢老师 13611825136

报名邮箱：wybiot@126.com



主办单位

玮瑜科研平台



承办单位

上海玮瑜生物科技有限公司

上海焦务科技服务中心



会务费用

（1）费用：8800元/人

（2）发票名目：可开会务费会议费注册费检测费统计分析服务费等发票



汇款账号

A：汇款账户

账户名称：上海焦务科技服务中心

账 户 号：9734 0078 8012 0000 0311

开 户 行：上海浦东发展银行大华支行

B：支付宝转账

收款人：wybiot@163.com   支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司

C：信用卡或公务卡支付

微信或支付宝扫描二维码支付，通过信用卡/公务卡扣款



报名方式

报名方法一：邮箱报名：编辑您的姓名手机号码 参加班级发送到wybiot@126.com9.19-20

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临床预测模型类论文主题培训班

9.19-20

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肠道菌与代谢研究课题设计实验数据分析

9.19-20

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2022年基金标书撰写专家指导和学员经验分享会

9.19-20

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多模态脑影像数据的处理与分析零基础实操培训班

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CNS文章的生信分析怎么做？包教包会学单细胞测序chipseqRNAseqAtacseqR语言

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