(策略篇)甲基化:一个与lncRNA剪不断理还乱的主题

 

第三季最后一个主题:甲基化...



大家好,今天到后面几天介绍lncRNA与甲基化的研究策略,这是第三季的最后一个主题了。

在前面的内容里,我们从lncRNA的角度介绍过:

蛋白泛素化修饰导致的蛋白降解,

蛋白翻译能力的上升导致的蛋白高表达,

蛋白的磷酸化修饰导致的蛋白活性改变,

蛋白由于定位改变导致功能的改变;

还介绍过lncRNA和circRNA通过影响mRNA的稳定性调控基因表达,

也介绍过转录因子对mRNA产生的影响;

介绍完蛋白和RNA,终于到甲基化了。当然,甲基化也可以发生在DNA、RNA、蛋白等多种分子水平,即使是一个水平的甲基化修饰,要说清楚也是很难的。

我们先看下甲基化有关的基金:

  • DNA的甲基化:
  1. UHRF1和异常DNA甲基化在视网膜母细胞瘤发生中作用的研究
  2. 基于DNA甲基化调控GATA转录因子活性研究內异方改善子宫内膜异位症炎症微环境的作用机制
  3. DNA甲基化调控的AK5和EYA4基因在膀胱癌对多药物耐受中的作用及机制的系统研究
  • RNA的甲基化:
  1. m6A RNA 甲基化在镍、镉诱导的细胞恶性转化中的作用及机制
  2. RNA甲基化修饰对体细胞重编程的调控作用及机制研究(?)
  3. RNA甲基化转移酶NSun2对乳腺癌发生发展的调控机制研究(?)
  • 蛋白的甲基化:
  1. 组蛋白甲基化转移酶EZH2在小鼠精原干细胞增殖和分化过程中的作用机制研究
  2. 组蛋白甲基化修饰在叶酸引起的神经管畸形中的作用和分子机制研究
  3. S100A8核移位通过SETD2介导组蛋白甲基化异常增加炎症相关结直肠癌微卫星不稳定性
胞嘧啶核苷酸的甲基化修饰
在梦熊前面写的文章 “(文章篇)S3E13:lncRNA参与基因调控的DNA去甲基化的作用”中,lncRNATARID就是通过对抑癌基因TCF21(DNA)启动子区域的CpG岛进行去甲基化修饰,然后上调TCF21的表达最终发挥作用的(回复313看文章)。

我们再看下与甲基化和lncRNA有关的基金:

  • LncRNA-ANCR介导的组蛋白甲基化酶EZH2稳定性在乳腺癌转移中的作用和机制 2016
  • lncRNA过表达调节ABCG2基因DNA甲基化影响喉鳞癌多药耐药的分子机制研究2016
  • LncRNA-PVT1基因异常甲基化的调节机制及其在子痫前期发生中的作用研究2016
  • LncRNA ecG0S2-G0S2甲基化调控途径在重症肌无力T淋巴细胞免疫平衡中的机制研究2016
  • 启动子DNA甲基化修饰的长链非编码RNA调控乳腺癌转移的研究 2016
  • lincRNA-p21调控DNA甲基化介导颞叶内侧癫痫耐药的机制研究2016
  • 长链非编码RNA MEG3及其甲基化在胶质瘤发生发展中的调控机制研究 2015
最后我们看几篇非编码RNA与甲基化的文章:

1. H19 lncRNA alters DNA methylation genome wide by regulating S-adenosylhomocysteine hydrolase.Nat Commun. 2015 Dec 21;



S腺苷甲硫氨酸(SAM)是甲基化修饰过程中的甲基供体,SAM在提供甲基后被转换成S腺苷同型半胱氨酸(SAH),而SAH可以抑制SAM依赖的转甲基作用。SAHH是SAH的水解酶,因此SAHH的激活能够促进SAM依赖的甲基化修饰。而lncRNA H19可以结合SAHH酶,并抑制其功能,从而阻断了由DNA甲基转移酶DNMT3B介导的广谱甲基化修饰,最终调控基因表达。

2. Regulation of laryngeal squamous cell cancer progression by the lncRNA H19/miR-148a-3p/DNMT1 axis.Oncotarget. 2016 Mar 8
lncRNA H19抑制miR-148a-3p表达,而miR-148a-3p则抑制DNA甲基转移酶DNMT1的表达,从而影响基因的甲基化水平和表达,促进喉癌的病程进展。


3. Small RNA-mediated DNA (cytosine 5) methyltransferase 1 inhibition leads to aberrant DNA methylation. Nucleic Acids Res. 2015 Jul 13



miR-155-5p等microRNA可以结合并抑制DNMT1的活性,从而改变DNA的甲基化程度,最终改变基因表达。

好了,文章的案例先到这里,我们后面几期的文章将从DNA的甲基化、组蛋白的甲基化等方面阐述lncRNA在甲基化过程中的作用,敬请期待。

下期文章预告:

Long non coding RNA CCAL regulates colorectal cancer progression by activating  Wnt/β-catenin signallingpathway via suppression of activator protein 2α.Gut. 2015 May 20.

全文下载链接:http://pan.baidu.com/s/1nvPDqop 密码: t7iv

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