CircRNA最新研究进展速递

最新进展送给你，不用谢~...





今天小R来给大家八一八近期circRNA研究的一些进展，让大家感受一下circRNA的研究热度。

中国科学院北京生命科学院的研究人员通过对10种人类细胞系和62个果蝇样本circRNA内部组件的全面调查，揭示了circRNA的可变剪切事件是普遍存在的现象[1]。值得注意的是，大部分circRNA的可变剪切外显子很难被检测到，且富含不同的来源于 mRNA外显子中富集的剪切因子结合位点。研究人员发现，circRNA内的可变剪切事件偏向于定位在细胞核上，同时表现出组织及发育阶段的特异表达模式。这项研究表明：circRNA可变剪切事件的起源或衰变及circRNA可变剪切转录本的鉴定为研究circRNA的功能和形成提供了新的方向。该项研究成果于6月28日发表在《Nature communication》上。北京大学研究人员通过SUPeR-seq对人类卵母细胞和植入前胚胎进行了系统的转录组分析，包括带有polyA的mRNA和不带polyA的RNA[2]。他们鉴定了10,032个环状RNA，绝大多数环状RNA具有发育阶段特异性，而且受到了动态调控。许多环状RNA是母体表达的，可能在卵母细胞发生和受精卵形成过程中承担着重要的调控功能。对比人类和小鼠胚胎，研究人员发现人类植入前胚胎的环状RNA种类比小鼠胚胎多。此外，他们还组装了新的转录单元，不少转录单元是潜在的长非编码RNA。这项研究为人们提供了宝贵的资源，有助于进一步揭示环状RNA在胚胎发育中的独特功能和复杂调控机制。该研究成果于6月17日发表在《Genome biology》上。来自西南医科大学和重庆医科大学的研究人员利用基因芯片对4位膀胱癌患者的癌症和癌旁组织的lncRNA、circRNA及mRNA的表达模式进行了研究[3]。研究发现有数千个lncRNA和mRNA、数百个circRNA在癌组织中存在显著的改变。5个异常的lncRNA和4个mRNA在30对癌症样品中被定量RT-PCR验证。进一步的共表达网络分析表明LncRNA APLP2与PTEN和TP53INP1等细胞凋亡基因相关。CeRNA网络推测LncRNA H19和circRNA MYLK能够竞争性的结合miRNA-19a-3p，从而上调其目标基因DNMT3B、VEGFA和ITGB1的表达。此外，表达模式表明表达量上调的与膀胱癌相关的基因ADAM2和C8orf4被LncRNA RP11-359E19.2顺式调控。该研究成果于5月30日发表在《Oncotarget》上。

不知各位看官是否已经感受到circRNA的研究热度？反正小R觉得我要再不做circRNA的研究就OUT了呢。

技术咨询热线：tech@biomarker.com.cn[1] Gao Y, Wang J, Zheng Y, Zhang J, Chen S, Zhao F: Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing events in circular RNAs. Nature communications 2016, 7:12060.

[2] Dang Y, Yan L, Hu B, Fan X, Ren Y, Li R, Lian Y, Yan J, Li Q, Zhang Y et al: Tracing the expression of circular RNAs in human pre-implantation embryos. Genome biology 2016, 17(1):130.

[3] Huang M, Zhong Z, Lv M, Shu J, Tian Q, Chen J: Comprehensive analysis of differentially expressed profiles of lncRNAs and circRNAs with associated co-expression and ceRNA networks in bladder carcinoma. Oncotarget 2016.

我们之前也推送过circRNA的相关内容哦，点击链接了解详情吧：circRNAs数据库- CircNet介绍

3分钟带你看透环状RNA

RNA中的“甄嬛”--环状RNA之功能验证

circRNA，还有你不知道的面孔

    关注 百迈客基因科技