芯片Meta分析 菜鸟进阶第一步

芯片Meta文章长啥样？...



Meta分析作为发文章的一种捷径, 虽然显得有些功利，但在缺乏时间开展新的实验或是没有能力开展大规模的临床实验时不失为一种好方法。

创新从模仿开始，今天我们以一篇芯片Meta分析文章为例，来看看芯片Meta分析的基本思路。



Meta分析

Meta分析作为系统评价的一种，简单来说是一种定量合成的统计学方法，其是对具有相同研究目的的多个独立研究结果进行系统的、定量的统计学分析与综合评价的一种研究方法，是对文献资料的再分析。

通过 Meta分析可以达到以下目的: 

1. 提高统计检验效能;
2. 评价结果一致性,解决单个研究间的矛盾;
3. 回答一些尚无确切答案或有多种不同解释的问题；
4. 改进对作用效应的估计

分析案例



Hepatocellular carcinoma associated microRNA expression signature: integrated bioinformatics analysis, experimental validation and clinical significance

相关疾病：肝癌

样本数：1250对

Meta分析方法:RRA 

IF：5.008

高通量miRNA研究中会因平台的不同及样本量小等问题而导致结果的不一致性。

这篇文章作者收集了26个已发表的miRNA文章数据，试图通过Meta分析找出与肝癌相关、可作为临床诊断生物标志物的miRNA。 收集与甄别文献

作者首先在GEO，web of science，ArrayExpress数据库中查找13年12月31日前有关肝癌miRNA表达谱数据相关的文章，并筛选出实验设计为人的癌和癌旁组织样本的原始文献作为后续分析。

作者最终筛选出了26篇文献，总样本量达到1250对，26个样本芯片数据具体信息如下：

 数据构建

在进行数据处理之前，作者首先根据miRbase21版将各个样本的miRNA进行了统一命名。

先将差异miRNA（p值

    关注 GCBI知识库