百迈客首版“新型冠状病毒基因组数据分析综合平台”免费向科研人员开放

 

研究人员可便捷下载基因组,数据资源,亦可通过我们部署的,blast、GBrowse、Primer Design 等工具完成相关的初步,数据分析、挖掘。...





新型冠状病毒疫情对我国人民的生产生活,产生了较大影响,牵动着大家的心。举国上下都十分重视,我们的一线医护人员冲在了抗击,疫情的最前线,大家也都从各方面,提供着各种援助,充分体现了我们一方,有难八方支援的优良传统。

作为一种新型冠状病毒,我们对它的了解还不够,我们的临床科学家们也在想尽各种办法,加班加点研究这种新型冠状病毒,以便尽快研究清楚它的,生物学分子机理,正如1月26日,在国务院新闻办疫情新闻发布会,上,中国疾病预防控制中心主任高福院士,表示的,要结合多种技术手段来帮助做,病毒的解析。百迈客作为三代测序和生物,云服务提供商,结合自身的技术特点,也积极的参与到抗击疫情,的战斗中,用自己的技术为,抗击疫情贡献一份力量。

针对此次疫情,百迈客积极与一线,的医护和科研人员合作,结合一线的需求,积极调动各种资源,经过十几天夜以继日的,开发,终于把第一版,新型冠状病毒(nCov)基因组数据库分析,平台上线,为我们的一线科研人员,提供免费服务。现把阶段性开发进展和支持,方式公布如下,希望对加快破解和管控疫情,提供有效支撑:

1、 “病毒数据库&自动化分析平台/工具” 向社会免费共享

自2019年12月,疫情首现以来,百迈客研发团队及时,跟进疫情研究进展。目前已完成一期研发计划,我们通过对各数据库中的新型冠状病毒数据,进行合理整合分析,及时搭建了首版“新型冠状病毒数据库,分析平台”(http://ncovdb.biocloud.net/home) ,本数据库于2020年1月,27日20:00时正式上线。本数据库将配合国家公共资源数据库为,社会提供更全面、及时、准确的数据资源。



数据库部署了31个新型冠状病毒,基因组序列,其中MN938384、MN908947、mn975262等毒株均已,补充详细的基因组、编码基因及蛋白序列信息,我们还基于这31个毒株,2株mers作为外源,构建了物种进化树,以便更清晰解读新型,冠状病毒的进化树起源。研究人员可便捷下载基因组,数据资源,亦可通过我们部署的,blast、GBrowse、Primer Design 等工具完成相关的初步,数据分析、挖掘。

我们将持续跟进、并更新该数据库,为国内外科研工作者提供方便快捷的数据,检索及下载服务。在随后的二期、三期研究计划中,我们会继续部署各种自动化,分析工具,分析保守域、毒株间的变异信息,寻找其间的共性,的突变信息,为病毒致病机理的研究、疫苗的开发等提供,技术支持。

2、三代纳米孔技术(孔,技术)助力病毒变异监测

三代测序技术作为基因组学研究,的新兴技术,对病毒的组学,研究有着重要作用,作为全球领先的三代测序,技术服务提供商,百迈客生物与战略合作,伙伴oxford nanopore公司联合协调了5套,minion测序平台及配套试剂盒,各位疫情防控,专家如有需求,联系评估后随时无偿配发,保证前线专家做好对疫情,的实时监控、及时分析;如有建好的2019-ncov病毒测序文库也可以,结合送样要求,联系我们。

附录:样品要求



3、已配备专业生物,信息分析团队,并向社会无偿提供信息分析技术支持

疫情爆发以来,我们组织20余人的生信分析团队,提前结束假期,不断针对发布的病毒,基因组进行研究分析,随时待命加入抗击,疫情的队伍。同时,百迈客亦诚恳邀请、欢迎各位专家学者共同探讨,疫情防控良策,请联系18514282648(微信同号)进群讨论。

4、其它可调配资源

如果前线专家需要其它生物技术支持资源,百迈客生物将不遗余力提供,最大的帮助。

希望大家将此信息转发到疫情抗战前线,专家人员的手中。

24小时对接联系人:

I.数据库使用&数据分析对接人:

负责人:王老师

手机:18514282648(同微信)

邮箱:wangf@biomarker.com.cn

II.样品准备&测序对接人:

负责人:康老师

手机:16622926288(同微信)

邮箱:kangjm@biomarker.com.cn

我们将全力协调,公司各种资源,在基因组变异与进化,病毒感染与致病机理分析,病毒溯源等方面为国为民,贡献一份“微薄”之力,在生命的赛道上,分秒必争!

百迈客生物

2020年1月27日


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